MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 megaplasmid

Total Repeats: 25737

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012811	CGG	2	6	361312	361317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142098
6002	NC_012811	GCC	2	6	361331	361336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142098
6003	NC_012811	CGC	2	6	361360	361365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142098
6004	NC_012811	GGC	2	6	361379	361384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142098
6005	NC_012811	GA	3	6	361392	361397	50 %	0 %	50 %	0 %	240142098
6006	NC_012811	AGGC	2	8	361403	361410	25 %	0 %	50 %	25 %	240142098
6007	NC_012811	GCC	2	6	361442	361447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142098
6008	NC_012811	GGC	3	9	361460	361468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142098
6009	NC_012811	GAC	2	6	361586	361591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142098
6010	NC_012811	CGC	2	6	361610	361615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142098
6011	NC_012811	GGC	2	6	361633	361638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142098
6012	NC_012811	GAG	3	9	361652	361660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142098
6013	NC_012811	GCA	2	6	361669	361674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142098
6014	NC_012811	CTG	2	6	361679	361684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142098
6015	NC_012811	GTA	2	6	361688	361693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240142098
6016	NC_012811	GCC	2	6	361709	361714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142098
6017	NC_012811	CGA	2	6	361720	361725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142098
6018	NC_012811	CGT	2	6	361732	361737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142098
6019	NC_012811	CGC	3	9	361762	361770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142098
6020	NC_012811	GGGC	2	8	361772	361779	0 %	0 %	75 %	25 %	240142098
6021	NC_012811	GAGCG	2	10	361790	361799	20 %	0 %	60 %	20 %	240142098
6022	NC_012811	CGT	2	6	361826	361831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142098
6023	NC_012811	CGC	2	6	361990	361995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142098
6024	NC_012811	GAGATC	2	12	362079	362090	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	240142098
6025	NC_012811	GCC	2	6	362117	362122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142098
6026	NC_012811	GCC	2	6	362261	362266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142098
6027	NC_012811	TCG	2	6	362295	362300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142098
6028	NC_012811	GTG	2	6	362340	362345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240142098
6029	NC_012811	CGG	2	6	362377	362382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142098
6030	NC_012811	CGC	4	12	362384	362395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142098
6031	NC_012811	GCG	2	6	362401	362406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142098
6032	NC_012811	AAAG	2	8	362425	362432	75 %	0 %	25 %	0 %	240142098
6033	NC_012811	CG	3	6	362441	362446	0 %	0 %	50 %	50 %	240142098
6034	NC_012811	GCT	2	6	362544	362549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142099
6035	NC_012811	GGC	2	6	362558	362563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142099
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6040	NC_012811	AG	3	6	362844	362849	50 %	0 %	50 %	0 %	240142099
6041	NC_012811	CCG	2	6	362871	362876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142099
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6043	NC_012811	CCTC	2	8	363055	363062	0 %	25 %	0 %	75 %	240142100
6044	NC_012811	GCAT	2	8	363081	363088	25 %	25 %	25 %	25 %	240142100
6045	NC_012811	CGG	2	6	363097	363102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142100
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6047	NC_012811	CCGA	2	8	363111	363118	25 %	0 %	25 %	50 %	240142100
6048	NC_012811	CGG	2	6	363137	363142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142100
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6050	NC_012811	GCT	2	6	363170	363175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142100
6051	NC_012811	TCC	2	6	363214	363219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142100
6052	NC_012811	CCG	2	6	363250	363255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142100
6053	NC_012811	GCG	2	6	363278	363283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142100
6054	NC_012811	TCC	2	6	363364	363369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142100
6055	NC_012811	AGG	2	6	363430	363435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142100
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6058	NC_012811	GCG	2	6	363535	363540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142100
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6062	NC_012811	CGGT	2	8	363650	363657	0 %	25 %	50 %	25 %	240142100
6063	NC_012811	CGC	2	6	363802	363807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142100
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6070	NC_012811	CCT	2	6	364057	364062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142101
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6079	NC_012811	GGCG	2	8	364657	364664	0 %	0 %	75 %	25 %	240142102
6080	NC_012811	GC	3	6	364709	364714	0 %	0 %	50 %	50 %	240142102
6081	NC_012811	CCG	2	6	364849	364854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142102
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6086	NC_012811	GCCGG	2	10	364960	364969	0 %	0 %	60 %	40 %	240142102
6087	NC_012811	CG	3	6	364994	364999	0 %	0 %	50 %	50 %	240142102
6088	NC_012811	CGT	2	6	365002	365007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142102
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6092	NC_012811	CAG	2	6	365101	365106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142102
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6094	NC_012811	G	6	6	365151	365156	0 %	0 %	100 %	0 %	240142103
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6100	NC_012811	CGA	2	6	365290	365295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142103
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6102	NC_012811	CGG	2	6	365336	365341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142103
6103	NC_012811	CGG	2	6	365367	365372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142103
6104	NC_012811	CGC	2	6	365399	365404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142103
6105	NC_012811	GC	3	6	365409	365414	0 %	0 %	50 %	50 %	240142103
6106	NC_012811	GCG	2	6	365437	365442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142103
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6109	NC_012811	CGA	2	6	365491	365496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142103
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6111	NC_012811	CAGC	2	8	365582	365589	25 %	0 %	25 %	50 %	240142103
6112	NC_012811	CGG	2	6	365663	365668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142103
6113	NC_012811	CTC	2	6	365685	365690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142103
6114	NC_012811	CG	3	6	365777	365782	0 %	0 %	50 %	50 %	240142103
6115	NC_012811	CGGCAT	2	12	365795	365806	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	240142103
6116	NC_012811	ACCT	2	8	365817	365824	25 %	25 %	0 %	50 %	240142103
6117	NC_012811	CAG	2	6	365861	365866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142103
6118	NC_012811	CGA	2	6	365873	365878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142103
6119	NC_012811	CGG	2	6	365902	365907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142103
6120	NC_012811	GTC	2	6	365925	365930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142103
6121	NC_012811	CGA	2	6	365948	365953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142103
6122	NC_012811	TCC	2	6	365967	365972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142103
6123	NC_012811	GGC	3	9	366026	366034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142103
6124	NC_012811	CTG	2	6	366036	366041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142103
6125	NC_012811	GCC	3	9	366069	366077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142103
6126	NC_012811	CGC	2	6	366206	366211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142103
6127	NC_012811	CGGC	2	8	366244	366251	0 %	0 %	50 %	50 %	240142103
6128	NC_012811	GAG	2	6	366261	366266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142103
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6130	NC_012811	GA	3	6	366285	366290	50 %	0 %	50 %	0 %	240142103
6131	NC_012811	GAC	2	6	366303	366308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142103
6132	NC_012811	CCT	3	9	366355	366363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142103
6133	NC_012811	CGT	2	6	366371	366376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142103
6134	NC_012811	CAT	2	6	366380	366385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240142103
6135	NC_012811	CCTG	2	8	366403	366410	0 %	25 %	25 %	50 %	240142103
6136	NC_012811	GGA	2	6	366497	366502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142103
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6141	NC_012811	CGG	2	6	366731	366736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142103
6142	NC_012811	CGC	2	6	366746	366751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142103
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6144	NC_012811	CGG	2	6	366818	366823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142103
6145	NC_012811	CAC	2	6	366836	366841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240142103
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6149	NC_012811	GCT	2	6	367031	367036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142103
6150	NC_012811	CGC	2	6	367076	367081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142103
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6152	NC_012811	CGG	2	6	367099	367104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142103
6153	NC_012811	TCG	2	6	367138	367143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142103
6154	NC_012811	CCT	2	6	367144	367149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142103
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6158	NC_012811	GC	3	6	367274	367279	0 %	0 %	50 %	50 %	240142103
6159	NC_012811	GC	3	6	367288	367293	0 %	0 %	50 %	50 %	240142103
6160	NC_012811	GGC	2	6	367298	367303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142103
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6164	NC_012811	CGA	2	6	367427	367432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142103
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6177	NC_012811	GACG	2	8	367970	367977	25 %	0 %	50 %	25 %	240142103
6178	NC_012811	TCT	2	6	367990	367995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240142103
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6180	NC_012811	ACG	2	6	368041	368046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142103
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6188	NC_012811	GTGGC	2	10	368427	368436	0 %	20 %	60 %	20 %	240142103
6189	NC_012811	CGCC	2	8	368447	368454	0 %	0 %	25 %	75 %	240142103
6190	NC_012811	CCG	2	6	368461	368466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142103
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6193	NC_012811	CGA	2	6	368534	368539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142103
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6195	NC_012811	GGC	2	6	368569	368574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142103
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6201	NC_012811	CGA	2	6	368835	368840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142104
6202	NC_012811	CG	3	6	368853	368858	0 %	0 %	50 %	50 %	240142104
6203	NC_012811	CCT	2	6	368928	368933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142104
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6217	NC_012811	GTCG	3	12	369305	369316	0 %	25 %	50 %	25 %	240142104
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6225	NC_012811	GCC	2	6	369643	369648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142104
6226	NC_012811	ACT	2	6	369704	369709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240142104
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6228	NC_012811	GCC	2	6	369742	369747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142104
6229	NC_012811	CTT	3	9	369759	369767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240142104
6230	NC_012811	AGA	2	6	369773	369778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240142104
6231	NC_012811	CGA	2	6	369894	369899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142104
6232	NC_012811	CTC	2	6	369910	369915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142104
6233	NC_012811	GAG	3	9	369958	369966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142104
6234	NC_012811	GAG	2	6	370018	370023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142104
6235	NC_012811	CGA	2	6	370056	370061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142104
6236	NC_012811	CGG	2	6	370068	370073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142104
6237	NC_012811	CG	3	6	370104	370109	0 %	0 %	50 %	50 %	240142104
6238	NC_012811	CGG	2	6	370161	370166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142104
6239	NC_012811	AGG	2	6	370232	370237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142104
6240	NC_012811	AGGC	2	8	370244	370251	25 %	0 %	50 %	25 %	240142104
6241	NC_012811	CCT	2	6	370332	370337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142104
6242	NC_012811	CGA	2	6	370353	370358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142104
6243	NC_012811	GCG	2	6	370394	370399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142104
6244	NC_012811	CTC	2	6	370405	370410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142104
6245	NC_012811	TCG	2	6	370415	370420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142104
6246	NC_012811	CGGT	2	8	370501	370508	0 %	25 %	50 %	25 %	240142104
6247	NC_012811	GCC	2	6	370531	370536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142104
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6250	NC_012811	TCG	2	6	370631	370636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142104
6251	NC_012811	CGA	2	6	370656	370661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142104
6252	NC_012811	ATCG	2	8	370671	370678	25 %	25 %	25 %	25 %	240142104
6253	NC_012811	GTG	2	6	370687	370692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240142104
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6255	NC_012811	CGG	2	6	370810	370815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142104
6256	NC_012811	CGG	2	6	370818	370823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142104
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6269	NC_012811	TCG	2	6	371228	371233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142104
6270	NC_012811	CGA	2	6	371234	371239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142104
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6273	NC_012811	GGC	2	6	371331	371336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142104
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6281	NC_012811	CCG	2	6	371510	371515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142104
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6283	NC_012811	CT	3	6	371585	371590	0 %	50 %	0 %	50 %	240142104
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6307	NC_012811	GTCG	2	8	372428	372435	0 %	25 %	50 %	25 %	240142105
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6321	NC_012811	CCT	2	6	374501	374506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142107
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6323	NC_012811	GA	3	6	374521	374526	50 %	0 %	50 %	0 %	240142107
6324	NC_012811	CGG	2	6	374542	374547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142107
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6330	NC_012811	GAC	2	6	374688	374693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142107
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6334	NC_012811	CCGG	2	8	374834	374841	0 %	0 %	50 %	50 %	240142107
6335	NC_012811	GGCGAT	2	12	374871	374882	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	240142107
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6338	NC_012811	GAT	2	6	374991	374996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240142107
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6343	NC_012811	GC	3	6	375234	375239	0 %	0 %	50 %	50 %	240142108
6344	NC_012811	TCG	2	6	375270	375275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142108
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6347	NC_012811	CTG	2	6	375362	375367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142108
6348	NC_012811	GCC	2	6	375416	375421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142108
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6350	NC_012811	CGC	2	6	375492	375497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142108
6351	NC_012811	AGC	2	6	375498	375503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142108
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6353	NC_012811	GAGG	2	8	375521	375528	25 %	0 %	75 %	0 %	240142108
6354	NC_012811	GCG	2	6	375539	375544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142108
6355	NC_012811	CTC	2	6	375545	375550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142108
6356	NC_012811	ATG	2	6	375567	375572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240142108
6357	NC_012811	CGG	2	6	375598	375603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142108
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6360	NC_012811	GCTTCT	2	12	375712	375723	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	240142108
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6480	NC_012811	CAACGC	2	12	379991	380002	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	240142113
6481	NC_012811	CGC	2	6	380106	380111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142113
6482	NC_012811	CGC	2	6	380123	380128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142113
6483	NC_012811	CTC	2	6	380148	380153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142113
6484	NC_012811	GCTC	2	8	380161	380168	0 %	25 %	25 %	50 %	240142113
6485	NC_012811	CAT	2	6	380183	380188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240142113
6486	NC_012811	CCTCGC	2	12	380198	380209	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	240142113
6487	NC_012811	CGC	2	6	380237	380242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142113
6488	NC_012811	CGC	2	6	380250	380255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142113
6489	NC_012811	CGG	2	6	380293	380298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142113
6490	NC_012811	CTT	2	6	380322	380327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240142113
6491	NC_012811	GCA	2	6	380345	380350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142113
6492	NC_012811	GGA	2	6	380351	380356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142113
6493	NC_012811	CCTC	2	8	380368	380375	0 %	25 %	0 %	75 %	240142113
6494	NC_012811	CTT	2	6	380378	380383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240142113
6495	NC_012811	GCC	2	6	380390	380395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142113
6496	NC_012811	CAC	2	6	380399	380404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240142113
6497	NC_012811	TCCTC	2	10	380414	380423	0 %	40 %	0 %	60 %	240142113
6498	NC_012811	CCG	2	6	380453	380458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142113
6499	NC_012811	TCG	2	6	380461	380466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142113
6500	NC_012811	GC	3	6	380477	380482	0 %	0 %	50 %	50 %	240142113

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